中国共产党东莞发展控股股份有限公司党支部委员会（以下简称“东莞控股党支部”）成立于2004年4月。为进一步完善基层党组织建设，2017年7月，东莞控股党支部升级为中国共产党东莞发展控股股份有限公司委员会（以下简称“东莞控股党委”），下设中国共产党东莞发展控股股份有限公司机关支部委员会、中国共产党东莞发展控股股份有限公司莞深高速公路分公司党支部委员会（以下简称“莞深高速公路分公司党支部”）及中国共产党广东融通融资租赁有限公司支部委员会。2018年8月，莞深高速公路分公司党支部因党员人数超过50人，改设为中国共产党东莞发展控股股份有限公司莞深高速公路分公司总支部委员会，下设中国共产党东莞发展控股股份有限公司莞深高速公路分公司第一党支部和中国共产党东莞发展控股股份有限公司莞深高速公路分公司第二党支部。目前，东莞控股党委共有党员84名。东莞控股党委的前身为东莞市莞深高速公路建设有限公司党支部，成立于2001年6月，2004年4月，更名为东莞发展控股股份有限公司党支部。
随着产融双驱发展战略的实施，公司进一步完善基层党组织设置，2017年7月，东莞控股党支部升格为东莞控股党委，下设三个党支部，分别为机关党支部、莞深高速公路分公司党支部、广东融通融资租赁有限公司党支部。
2018年8月，莞深高速公路分公司党支部改设党总支，下设莞深高速公路分公司第一党支部、第二党支部。